Struktur organisasi terdiri atas Kepala Balai, Subbagian Tata Usaha, serta jabatan fungsional dan jabatan pelaksana.
Kepala BLSDM Komdigi Jakarta
Kepala memimpin pelaksanaan tugas dan fungsi balai dalam menyelenggarakan pelatihan di bidang komunikasi, informasi, dan digital, serta bertanggung jawab kepada Kepala Badan Pengembangan Sumber Daya Manusia Komunikasi dan Digital.
Kepala Subbagian Tata Usaha
Kepala Subbagian Tata Usaha melaksanakan urusan perencanaan, program, anggaran, keuangan, kepegawaian, persuratan, kearsipan, rumah tangga, barang milik negara, kehumasan, kerja sama, sistem data dan informasi, manajemen risiko, serta evaluasi dan pelaporan kinerja balai.
Jabatan Fungsional
Jabatan fungsional memberikan pelayanan dan melaksanakan pekerjaan sesuai keahlian dan/atau keterampilan tertentu untuk mendukung pelaksanaan tugas dan fungsi balai.